目前最可能的假设是：

一种叫作甲烷八叠球菌的微生物因突变获得了一种从海洋中（以有机碳的形式）获取能量的新方式。这是一次巨大的成功，甲烷八叠球菌也疯狂繁殖。但在这个过程中，这种微小的有机体吐出了太多的甲烷，改变了海洋和天空的化学性质。

大量的甲烷造成了极大的温室效应，同时造成了海洋和大气的酸化。
在接下来的数百万年里，96%以上的海洋物种和70%以上的陆地脊椎动物灭绝了，海洋的表面温度一度升到40摄氏度。这次灭绝为恐龙腾出了生存空间。

造成大灭绝的元凶大概就是它了。

也有说法认为是因为火山爆发将甲烷八叠球菌生存必需的镍大量散布到海洋造成了甲烷八叠球菌的大量繁殖，其后发生的事情和上面一样。

参考文献：

Methanogenic burst in the end-Permian carbon cycle
https://www.pnas.org/content/111/15/5462.short

High-precision geochronology confirms voluminous magmatism before, during, and after Earth’s most severe extinction
http://advances.sciencemag.org/content/1/7/e1500470